Dự báo năm 2006, tình hình thế giới và khu vực tiếp tục diễn biến phức tạp. Trên biển Đông, tình trạng tranh chấp biên giới vùng biển, thăm dò khai thác trộm tài nguyên, lấn át ngư trường, vi phạm chủ quyền vùng biển của ta vẫn đang xảy ra. Hoạt động của các thế lực thù địch biến tướng dưới nhiều hình thức tinh vi cùng với thời tiết nhiều bất trắc khó lường như lụt, bão, triều cường có tác động không nhỏ đối với nhiệm vụ công tác  của lực lượng nước ta nói chung, Bộ đội Biên phòng Phú Yên nói riêng.

Vì vậy, Đảng ủy, Bộ Chỉ huy Bộ đội biên phòng Phú Yên chỉ đạo cán bộ, chiến sĩ toàn lực lượng tập trung vào bốn nhiệm vụ trọng tâm.

Đại tá Nguyễn Trúc Thơm phát biểu tại hội nghị

Một là, quán triệt và tổ chức thực hiện tốt các Nghị quyết của Đảng, Nhà nước, nhiệm vụ công tác biên phòng năm 2006 và Nghị quyết TW8 về chiến lược bảo vệ Tổ quốc trong tình hình mới, tăng cường công tác giáo dục chính trị, tư tưởng cho cán bộ chiến sĩ làm chuyển biến toàn diện, vững chắc về nhận thức, bản lĩnh chính trị và hành động cách mạng.

Hai là, phát huy sức mạnh tổng hợp của các cấp, các ngành, đấu tranh, ngăn chặn kịp thời các âm mưu, thủ đoạn phá hoại, giữ vững an ninh chính trị, trật tự an toàn xã hội trên khu vực biên giới biển đảo của tỉnh; Nâng cao chất lượng, hiệu quả công tác vận động quần chúng và xây dựng nền biên phòng toàn dân vững mạnh.

Ba là, hoàn chỉnh hệ thống tác chiến theo quy định; Chấp hành nghiêm chỉ thị, mệnh lệnh sẵn sàng chiến đấu, đối phó có hiệu quả các tình huống, không để bất ngờ thụ động.

Bốn là, tổ chức đảm bảo hậu cần – kỹ thuật, tài chính khả năng hiện có và huy động mọi nguồn lực đảm bảo cho thực hiện nhiệm vụ thường xuyên, đột xuất; Đẩy mạnh tăng gia sản xuất, đảm bảo cải thiện và từng bước nâng cao đời sống cán  bộ, chiến sĩ, công nhân viên.