Theo số liệu điều tra thống kê đến thời điểm 1/8/2007, do ảnh hưởng dịch bệnh lở mồm long móng gia súc tái phát nhiều năm liền và bệnh tai xanh ở heo mới xuất hiện ở các tỉnh lân cận nên tốc độ khôi phục và phát triển gia súc ở Phú Yên rất chậm.
Trong đó, đàn heo tuy có tăng 4,4% so với năm trước, nhưng giảm hơn 67.000 con so với năm 2005. Riêng đàn gia cầm, nhiều hộ chăn nuôi đã đầu tư tái tạo lại đàn nên tốc độ phát triển đàn gia cầm có tăng, trong đó: đàn gà tăng 3,8%, đàn thuỷ cầm tăng 5,9%.
Tính đến thời điểm trên, đàn gia súc gia cầm toàn tỉnh gồm có: Đàn trâu 3.782 con tăng 2% so với cùng thời điểm năm 2006; đàn bò: 233.596 con, tăng 2,2%, trong đó: đàn bò lai có 80.556 con, chiếm 34,5% tổng đàn (tăng 10,5% so với năm trước); Đàn heo 129.695 con, tăng 4,4%; Đàn dê: 11.026 con tăng 47,6%; Đàn gia cầm hơn 1,93 triệu con, tăng 4,9% so cùng kỳ năm 2006. Sản lượng thịt gia súc, gia cầm xuất chuồng 24.756 tấn, tăng 13,8%. Sản lượng trứng gia cầm đạt 72.424 ngàn quả tăng 6,4% so cùng kỳ năm trước.
ĐỨC TÍN