Theo kế hoạch công tác đào tạo nhân lực của ngành Y tế Phú Yên từ năm 2015- 2020, toàn tỉnh phấn đấu đưa đi đào tạo bác sĩ và bác sĩ sau đại học là 483 người.
Trong đó, đối tượng đào tạo cụ thể như sau: tiến sĩ 2, bác sĩ chuyên khoa II 32, bác sĩ chuyên khoa I, thạc sĩ 116, bác sĩ liên thông, cử tuyển, theo địa chỉ 166 và bác sĩ chính quy 167. Kết quả trong năm 2015, tỉnh đã thực hiện việc cử đào tạo bác sĩ liên thông, cử tuyển, theo địa chỉ là 36 người; đào tạo bác sĩ sau đại học là 29, chưa đạt kế hoạch đề ra. Cùng với đó, ngành Y tế Phú Yên thực hiện tốt công tác đào tạo liên tục như việc cử viên chức tham dự các lớp đào tạo, tập huấn tại các trường đại học y, các bệnh viện tuyến trên. Bệnh viện Đa khoa Phú Yên mở các lớp đào tạo về siêu âm tổng quát, đọc điện tim cho bác sĩ công tác tại bệnh viện tuyến huyện, trạm y tế.
V.HOÀNG