Qua kiểm tra tại 64 tỉnh, thành với 2.901 xã và 44 nghìn hộ vay vốn cho con em đi học đại học, cao đẳng, Bộ Giáo dục và Đào tạo đã phát hiện 1% hộ vay không thuộc diện khó khăn (do UBND xã, phường xác nhận sai), 0,02% hộ sử dụng vốn vay sai mục đích.
Để khắc phục, tháng 2/2008, Ngân hàng chính sách xã hội sẽ kiên quyết thu hồi nợ số hộ vay sai đối tượng. Bộ Giáo dục và Đào tạo sẽ xây dựng phần mềm theo dõi tình hình vay nợ của học sinh, sinh viên để ngân hàng thông báo cho nhà trường, cơ sở đào tạo về kết quả cho vay từng em và ngược lại nhà trường thông báo cho ngân hàng những trường hợp đã vay vốn nhưng chưa đóng học phí. Bộ Lao động - Thương binh và Xã hội có công văn chỉ đạo UBND các địa phương xác nhận đúng đối tượng vay vốn. Các trường yêu cầu học sinh, sinh viên làm cam kết việc trả nợ trước khi tốt nghiệp và khi có việc làm cần thông báo cho ngân hàng và cơ quan, đơn vị tuyển dụng vào làm việc.
Đầu tháng 2/2008, Bộ Tài chính chỉ đạo Kho bạc nhà nước chuyển 1.000 tỷ đồng tiền nhàn rỗi cho Ngân hàng Chính sách xã hội để có nguồn vốn cho vay trong học kỳ II năm học 2007-2008, bảo đảm không học sinh, sinh viên nào phải bỏ học vì thiếu tiền học phí.